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药物是用以预防、治疗及诊断疾病的物质。在理论上,药物是指凡能影响机体器官生理功能及细胞代谢活动的化学物质都属于药物的范畴,也包括避孕药。

PubChemPubChem,即有机小分子生物活性数据,是一种化学模组的数据库,目前由美国国家生物技术信息中心维护。PubChem可经由网站直接存取,数以百万计的化学组成资料集可经由FTP免费下载。

关于化合物结构式的内容都是药物化学方面研究的重点内容,咱们在这里就讲一个小方向,就是化学结构式和实验中如何给药相关知识

一般我们拿到一个化合物时,可能已知结构或者相关理化性质如解离常数(pKa)、表面特性、吸湿性、水中溶解度等,这些参数可以对配药方案的选择提供一些指导作用,但是在新药筛选阶段我们往往没有这些参数,最多只知道化合物结构。通过化合物结构中的亲水基团或者疏水基团可以对化合物的水溶性作初步判断,如下:

规律:一般亲水基团多的化合物水溶性比疏水基团多的好;亲水性好的助溶剂可以少用一点;碱性基团多时降低pH 可以提高溶解度,酸性反之,但注意不要使用对动物组织有刺激性的极端pH,合适的pH值范围为2-9。

然而,一般通过结构只能提供很少线索,如大概的亲水性等,有时候还可能会误传信息,像盐酸小檗碱,从结构上看,应是水溶性很好的。然而,实际却基本不溶。所以我们需要进一步去探究。

考虑到助溶剂和表面活性剂等的毒性,首先考虑使用单一溶媒:如水,生理盐水,或者10-40%的HP-β-CD/SBE-β-CD 水溶液,或者pH 2-9的buffer,不过大部分的化合物是没有这么好的水溶性的;

若不溶,进一步借助助溶剂:若单一溶媒不能溶解时,再考虑配方中加入助溶剂和表面活性剂等。极性较大的助溶剂有DMSO、DMA和NMP等,极性稍小的助溶剂有乙醇、PG和PEG等。

在具体实验研究中,我们一般是不断去摸索,下面为大家由简及繁的提供一些配方和适合的给药方式作为选择参考,从上到下,逐渐繁琐,可以依次尝试。

我们在查询物质的时候,经常会有一个物质的CAS号,而且每个物质都有一个独一无二的CAS号,就像人的指纹一样,那么今天我们就来瞅瞅这个CAS号的前世今生。

CAS其实是一个组织的简称,美国化学文摘社(Chemical Abstracts Service,简称CAS),是美国化学会(关于美国化学会:本科生/研究生的我,有什么途径可以很方便关注科研动态?)的一个分支机构,负责整理并发行化学文摘及其相关产品。化学文摘社提供世界上最大的公开披露的化学相关信息的数据库,并且提供相关的文献检索软件为用户提供原始文献和专利的链接。尽管不同的数据库及检索工具有不同的名称,它们通常被统称为“化学文摘”。

如果你是研究生的话,那么就会接触到化学文摘社的很多数据库和软件产品。比较常见的例如SCI-Finder,SCI-Finder 是化学文摘社所出版的《Chemical Abstract》化学文摘(简称CA)的在线版数据库学术版,我们很多中文期刊在描述头衔的时候很多都会显示美国化学文摘收录,说的就是这个数据库。除可查询每日更新的CA数据回溯至 1907年外,更提供读者自行以图形结构式检索。它是全世界最大、最全面的化学和科学信息数据库。

而CAS号只是化学文摘社的其中一个工作任务,就是给每一个文献中出现的物质一个编号,避免化学物质有多种名称的麻烦,使数据库的检索更为方便。1965年,CAS化学品登记系统问世,CAS号成为检索化学品的标准,造福了整个化学研究界。目前基本上所有的化学数据库的检索都支持CAS号检索,包括Aspen Plus的物质输入,也支持CAS号。

那么CAS编号是按照什么编号规则来的呢?这就是一个小小的冷知识了。CAS编号以连字符“-”分为三部分,第一部分有2到7位数字,第二部分有2位数字,第三部分有1位数字作为校验码。CAS编号以升序排列且没有任何内在含义,校验码的计算方法如下:CAS号(第一、二部分数字)的最后一位乘以1,最后第二位乘以2,往前依此类推,然后再把所有的乘积相加,和除以10,余数就是第三部分的校验码。举例来说,水(H2O)的CAS编号前两部分是7732-18,则其校验码= ( 8×1 + 1×2 + 2×3 + 3×4 + 7×5 + 7×6 ) /10 = 105/10 = 10余5,所以水的CAS号为7732-18-5。

最后,如果我们需要获取一个物质的CAS编号,那么哪些网站会比较全呢?这里主要推荐两个:

当然,推荐的这两个网站还有很多其他的功能,比如物质基础性质、MSDS、产品价格、海关数据等等,大家可以去好好发掘。

药物需要一定的亲水性,又需要其具有一定的亲脂性,即两亲性有利于吸收。药物亲水性或亲脂性的过高或过低都对药效产生不利的影响。这种性质常用脂水分配系数表示怎样注册美国苹果id,也称为油水分配系数,其值越大,越易溶于脂,反之则越易溶于水。

本文将从脂水分配系数定义、计算脂水分配系数的方法、脂水分配系数的影响因素、脂水分配系数对药物开发的影响和小结五个部分分享脂水分配系数与药物活性“脉脉相通”。

有机化合物的脂水分配系数通常是指化合物在正辛醇和水两相间的分配系数,以其对数来表示,记为logP:

其中Coct和Cw分别为化合物在正辛醇和水两相间达到平衡时的浓度。通常P给出的是中性化合物在两相间的分配系数。

对于可电离的化合物,则使用分配率D来表示溶质在两相间总的分配系数。例如,对于可电离的溶质HA可有:

其中[HA]、[A-]分别代表溶质的中性状态和离子状态的浓度。D是与溶质的酸碱解离常数pKa以及溶液的pH值相关的参数。因此,表示LogD的时候常常有pH值作为后缀,比如LogDpH7.4。

测定化合物logP常用的方法有摇瓶法、反相高效液相色谱法和软件预测等。因此logP可以通过实验或者软件预测方法得到。但实验法需要得到纯度较高的物质,并且耗时长、花费较大。软件预测方法得到的数据虽然精度略差,但具有速度快、不需要获得物质、成本低等众多优点,受到很多研究者的欢迎。

简单来说,摇瓶法是摇动一个装有两种互不相溶溶剂和一种溶质的烧瓶,待达到平衡后,分析溶质在其中一相或两相中的浓度,从而计算logP。

2013年,天津药物研究院米楠等[1]以正辛醇-磷酸盐缓冲液作为分散系统,摇瓶法作为测定方法,采用紫外-可见分光光度法进行测定。通过阿齐沙坦分配平衡后在油相(正辛醇)和水相的浓度比,计算油水分配系数。

在正辛醇-磷酸盐缓冲液体系中,pH=3.0时阿齐沙坦的油水分配系数为3.78,pH=7.0时阿齐沙坦的油水分配系数为-0.30。

反相高效液相色谱法被广泛的用来进行化合物或药物logP的间接测定。这种方法是基于化合物的保留性质与分配系统的相关性模型。然后,根据化合物在分离体系中的保留性质可以计算其logP。

反相高效液相色谱法具有操作简单、快速、费用低、重复性好的优点,是一种很好的间接测定方法,但该法选取不同的标样化合物对实验结果的影响较大[2]。宋斌等人[3]应用反相高效液相色谱法测定了几种酚类化合物的正辛醇/水分配系数(Kow),建立了容量因子(k)与Kow的关系方程,考察了标样化合物结构对测定结果的影响。

如表1所示,实验结果表明,反相高效液相色谱法是一种有效测定物质Kow的方法,且标样化合物的结构对测定结果有较大影响。

软件预测的软件和网站有很多,比如虚拟化学实验室网站提供的10种常用分配系数(正辛醇/水)预测软件(ALOGPs、AC logP、AB/LogP、COSMOFraq、miLogP、ALOGP、MLOGP、KOWWIN、XLOGP 2、XLOGP 3)[4,5]。但化学工作者经常使用ChemBioDraw Ultra进行初步的clogP预测[6,7],如图1用该方法对阿齐沙坦进行logP预测。这是因为化学工作者基本都会安装ChemBioDraw Ultra(一款专业可靠的化学分子结构及化学图形绘制工具),使用较为方便。

药物分子结构的改变,当分子中官能团形成氢键的能力和官能团的离子化程度较大时,药物的水溶性会增大。如氨基、羟基、硝基、磺酸基等。

相反若药物结构中含有较大的烃基、卤素原子、脂环等非极性结构,导致药物的脂溶性增大。

足够的亲水性能够保证药物分子溶于水相,适宜的亲脂性保障药物对细胞膜的渗透性。因此,在药物化学设计药物时要充分考虑官能团对脂水分配系数的影响[8]。

如表2所示,作用于中枢神经系统的药物,需要通过血脑屏障,因此需要较大的脂水分配系数。作用于局部,不需要透过血脑屏障进入脑组织,脂溶性要求与全麻药不同,但是在穿透局部的神经组织细胞膜时须有一定的脂溶性才能穿透脂质生物膜,使药物在局部浓度高。

对于药物化学研究而言,脂水分配系数是十分重要的物理化学性质。它们用于研究有机化合物在生物体内的行为,在许多生物过程及物理化学过程中都是重要的参数。

药物只有能够在生物体内自由传输,顺利通过生物膜直至抵达病灶,才能起到治疗疾病的作用。因此,有机化合物的一些基本性质,例如吸收、分布、代谢、排泄等药代动力学性质以及毒性修改美国苹果id,与其最终是否能够成药至关重要。人体约70%由水组成,血浆中水的含量更是高达90%以上。这表明了药物在人体中的运输过程与药物的水溶解度密切相关。生物膜的脂质双分子层具有疏水性,因此药物通过各种生物膜的过程可以视作是在水和疏水介质之间的再分配,所以这种过程与其脂水分配系数密切相关[8]。

如果有机化合物的水溶性不佳,影响了其在体内的吸收过程,则其成药性一般也比较差。较低的溶解度也可能会对给药模式产生很大的影响。总的来说,在药物研发前期中对于脂水分配系数与溶解度数据的预测对化合物最终是否可以成药具有很大的影响

质谱,即质量的谱图,物质的分子在高真空下,经物理作用或化学反应等途径形成带电粒子, 某些带电粒子可进一步断裂,形成离子,质谱的离子可以质谱的核心内容,今天就和大家聊一聊质谱使用者都应该知道的离子。

质谱,物质的分子在高真空下,经物理作用或化学反应等途径形成带电粒子, 某些带电粒子可进一步断裂,形成离子,每一离子的质量与所带电荷的比称为质荷比(m/z,曾用m/e),不同质荷比的离子经质量分离器一一分离后,由检测器测定每一离子的质荷比及相对强度,由此得出的谱图称为质谱。

分子被电子束轰击失去一个电子形成的离子称为分子离子。分子离子用 M+表示。分子离子是一个游离基离子。在质谱图中与分子离子相对应的峰为分子离子峰。分子离子峰的质荷比就是化合物的相对分子质量, 所以,用质谱法可测分子量。

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含有同位素的离子称为同位素离子。在质谱图上,与同位素离子相对应的峰称为同位素离子峰。

经重排裂解产生的离子称为重排离子。其结构并非原来分子的结构单元。在重排反应中,化学键的断裂和生成同时发生, 并丢失中性分子或碎片。

具有未配对电子的离子为奇电子离子。这样的离子同时也是自由基,具有较高的反应活性。无未配对电子的离子为偶电子离子。

分子中带有不止一个电荷的离子称为多电荷离子。当离子带有多电荷离子时,其质核比下降,因此可以利用常规的四极质量分析器来检测大分子量化合物。

从离子源出口到检测器之间产生的离子。即在飞行过程中发生裂解的母离子。由于母离子中途已经裂解生成某种离子和中性碎片,记录器中只能记录这种离子,也称这种离子为亚稳离子,由它形成的质谱峰为亚稳峰。

比分子量多或少 1 质量单位的离子称为准分子离子,如:(M+H)+, (M-H)+。其不含未配对电子,结构上比较稳定。

分子离子是质谱图中最有价值的信息,它不但是测定化合物分子量的依据,而且可以推测化合物的分子式,用高分辨质谱可以直接测定化合物的分子式。

一般来讲,从分子中失去的电子应该是分子中束缚最弱的电子,如双键或叁键的π电子,杂原子上的非键电子。

分子离子的丰度主要取决于其稳定性和分子电离所需要的能量。易失去电子的化合物,如环状化合物、双键化合物等,其分子离子稳定、分子离子峰较强;而长碳链烷烃、支链烷烃等正与此相反。

芳环 (包括芳杂环) 、脂环化合物、硫醚、硫酮、共轭烯分子离子峰比较明显,直链酮、酯、酸、醛、酰胺、卤化物等通常显示分子离子峰,脂肪族醇、胺、亚硝酸酯、硝酸酯、硝基化合物、腈类及多支链化合物容易裂解, 分子离子峰通常很弱或不出现。

分子离子峰不出现或丰度极低难以确认,可根据不同情况改变实验条件予以验证。

将常用的70eV 改变15eV 以减少形成的分子离子继续断裂的几率,降低了碎片离子的丰度,使分子离子峰的相对丰度增加,从而可能辨认出分子离子。

降低轰击电子能量的结果会使仪器的灵敏度下降,虽然分子离子峰的丰度有所提高,但离子的绝对强度降低,一些由于热不稳定和低挥发性等原因而不出现分子离子峰的化合物,用这种办法不会得到预期的效果,这时可采取各种软电离的办法,虽然碎片离子大量减少,但可以突出分子离子峰。

气化温度的降低可以减少分子离子进一步断裂的可能性,分子离子峰的相对丰度增加。如三十烷烃在340℃时气化,不出现分子离子峰,改变70℃气化时分子离子峰的丰度接近基峰。

某些化合物不易挥发或热稳定性差,可以衍生化处理。例如,可将某有机酸制备成相应的酯,酯容易气化,而且易得到分子离子峰,由此来推断有机酸的分子量。

解析时一般把谱图中最高质荷比的离子假设为分子离子,后用分子离子的判别标准一一对比,若被检查离子不符其中任何一条标准,则它一定不是分子离子;若被检查离子符合所有条件,则它有可能是分子离子。分子离子的判别可以参考如下标准:

(1)分子离子必须是奇电子离子。由于有机分子都是偶电子,所有失去一个电子生成的分子离子必是奇电子离子。

(2)是否符合氮规则 (Nitrogen Rule) 。有机化合物的分子量是偶数或奇数与所含有的氮原子的数目有关。凡不含氮原子或含偶数个氮原子的化合物,其分子量必为偶数;含奇数个氮原子的化合物,其分子量必为奇数,这就是所谓的氮规则。

(3)合理的中性碎片的丢失。这些中性碎片可能是小分子或者自由基基团。这些中性碎片有着特殊的质量数,m/z最高值与邻近的碎片离子之间应有一个合理的质量差。

例如:M+丢失一个质子H、CH3、H2O,C2H4等是合理的。如果这个质量差落在4~14和21~25之间就是不合理的,也即如果在M-4到M-13的范围内存在峰,则说明原所假定的分子离子峰不是分子离子峰。

碎片离子的质荷比及其丰度在质谱数据中占很大比例。碎片离子的相对丰度与分子结构有密切关系,高丰度的碎片峰代表分子中易于裂解的部分,如果有几个主要碎片峰,并且代表着分子的不同部分,则由这些碎片峰就可以粗略地把分子骨架拼凑起来。质谱解析的大量工作就是分析碎片离子的形成过程。

分子失去电子,形成游离基离子,它的电子有强烈的成对倾向,电子转移与邻近原子形成一个新键,同时邻近原子的α键断裂。因此,这种断裂通常称为“α”断裂反应。

(1)饱和杂原子:杂原子的孤对电子电离能较低,很容易去失,形成游离基离子,进而发生α断裂,如:

上述反应的进行与游离基中心给电子倾向有密切的关系。氮原子给电子能力很强,α断裂在脂肪族胺中占主导地位,其次是氧族元素,由给电子能力的差别造成的α断裂反应的难易程度按下列顺序排列:NS、O、π,RCl、BrH。当一个化合物有几个α键时,最容易去失的是最大的烷基游离基。

诱导断裂是由正电荷诱导、 吸引一对电子而发生的断裂, 其结果是正电荷的转移。诱导断裂常用i来表示。一般情况下,电负性强的元素诱导力也强。在有些情况下,诱导断裂和α断裂同时存在。由于i断裂需要电荷转移,因此,i断裂不如α断裂容易进行。

表现在质谱中,相应α断裂的离子峰强,i断裂产生的离子峰较弱。例如,i断裂和α断裂同时存在,α断裂的几率大于i断裂。但由于α断裂生成的m/z 59还有进一步的断裂,因此在的质谱中,m/z59并不比m/z 29强。

如果化合物分子中具有σ键,如烃类化合物,则会发生σ键断裂。σ键断裂需要的能量大,当化合物中没有π电子和n电子时,σ键的断裂才可能成为主要的断裂方式。断裂后形成的产物越稳定,这样的断裂就越容易进行,阳碳离子的稳定性顺序为叔仲伯。因此,碳氢化合物最容易在分支处发生键的断裂。并且,失去最大烷基的断裂最容易进行。

重排开裂时涉及到两个键的断裂,脱去一个中性分子,同时发生H重排。重排的结果产生了在原化合物中不存在的结构单元的离子。

分子离子或碎片离子结构中有双键,且在γ位上有H原子的正离子都能发生麦氏重排。在开裂中,γ位上的H通过六元环过渡态的迁移到电离的双键碳或杂原子上,同时烯丙键断裂,生成中性分子和碎片离子。

醛、酮、羧酸、酯、酰胺、碳酸酯、磷酸酯、肟、腙、烯、炔以及烷基苯等的含有γ-H的有机化合物很容易发生麦氏重排。

对具有环内双键结构的化合物能发生RDA开裂,一般生成一个带正电荷的共轭二烯自由基和一个中性分子。

在一些醇类、硫醇类、卤代烃等有机化合物分子的质谱中经常出现脱去水、硫化氢、卤化氢等小分子化合物而生成的碎片离子。醇非常容易脱去水分子,所以醇类化合物的分子离子峰相对丰度很小,甚至不出现分子离子峰。

复杂开裂是指在有机化合物的质谱中,经常出现离子中两个或两个以上化学键连续发生断裂生成碎片的过程。除了重排反应以外,环状化合物的质谱碎裂也是如此。复杂断裂一般是指环状化合物发生的多个键断裂,有时涉及一个氢原子的转移。

骨架重排是指在有机化合物裂解过程中,部分基团如甲基、芳香基以及含O、N、S等的基团发生迁移,生成一些小的中性碎片、自由基离子等的过程。常见的中性碎片如CO、SO、SO2, S2, CH=CH等。如蒽醌发生芳基迁移,存在下列裂解:

药物本身都有肝脏毒性,药物是人体的解毒工厂几乎负责了所有进入人体的食物和药物的解毒功能,但是是药三分毒,药品很容易伤害肝脏,据有关统计可以发,药物性肝损害的药物超过1000种,尤其以抗结核药,降脂药抗生素为主。药物性肝病是指药物所引起的肝脏损伤,可发生于以往没有肝病的健康人群,或者有严重疾病的病人

俗话说“是药三分毒”,并非所有的天然产品都是无害的,肝毒性可能是草药和膳食补充剂(保健品)最常见的不良反应。在2015年发表的美国的一项关于药物性肝损害的临床研究中发现,在引起急性肝功能衰竭的药物中,草药和膳食补充剂(保健品)所导致的急性肝功能衰竭排在第二位(占比19%),第一位是对乙酰氨基酚(占56%,一般西药复方感冒药、止痛药等药物中多含有对乙酰氨基酚),第三位才是抗生素(占6%)。

药物的剂量,一般对于肝细胞有直接毒性的药物剂量越大,所造成的肝损害越严重。药物应用的时间长短,由于肝损害有关,比如某些药物如果用药到三个月以上就会发生。另外对于人体的性别是有关的,比如有些女性,就容易多发生药物性肝损伤。

一般老年人机体发生药物肝毒性,主要的原因是由于肝细胞内的没修物质活性降低,对于某些药物的代谢能力降低,所以会造成毒性不能及时排出体外。另外老年人经常并存多种慢性疾病,用药物会进行相互的干扰。

人体的营养状态也是和药物毒素有关的,如果营养缺乏,比如蛋白质缺乏,使得干预的保护因子降低。另外有些肝硬变的患者对某些药物的代谢作用也会降低,以至于毒性物质积蓄肝内,造成肝损害。

THE END
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